Desde el año de 1975, la Corte Plena inició una serie de análisis sobre la situación administrativa del Poder Judicial que culminó con la promulgación de la Ley N ° 6152 del 18 de noviembre de 1977 y a la creación de la Dirección Administrativa la cual inició funciones a partir del 16 de enero de 1978. Nació como respuesta a la necesidad de eximir a la Corte Plena de muchas actividades administrativas que realizaba.
La reforma a la Ley Orgánica del Poder Judicial, N° 7333 del 1 de julio de 1993, transformó la Dirección Administrativa en Dirección Ejecutiva.
Dentro de la estructura administrativa de la Dirección Ejecutiva se cuenta el Macro Proceso Financiero Contable, nombre que ha cambiado a través del tiempo.
Sesión Nº 34-90 del 14 de mayo de 1990, cambia de Departamento de Contaduría Judicial a Departamento Financiero Contable del Poder Judicial.
Sesión Nº 14-087 del 21 de febrero de 2007, fue aprobada la estructura organizacional por procesos con el consecuente cambio a Macro Proceso Financiero Contable.